home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Shareware Overload Trio 2 / Shareware Overload Trio Volume 2 (Chestnut CD-ROM).ISO / dir26 / med9410p.zip / M94A3316.TXT < prev    next >
Text File  |  1994-10-25  |  3KB  |  48 lines
  1.        Document 3316
  2.  DOCN  M94A3316
  3.  TI    Detection of reverse transcriptase (RT) codon 215 mutations by PCR in
  4.        HIV-infected adults: correlation with clinical disease.
  5.  DT    9412
  6.  AU    Nelson R; Bradley W; Day N; Good R; Univ. South Florida/All Children's
  7.        Hospital, St. Petersburg; 33701.
  8.  SO    Int Conf AIDS. 1994 Aug 7-12;10(1):104 (abstract no. PA0033). Unique
  9.        Identifier : AIDSLINE ICA10/94369259
  10.  AB    OBJECTIVE: To rapidly detect mutations of the HIV-1 reverse
  11.        transcriptase codon 215 (associated with azidothymidine resistance) from
  12.        peripheral blood DNA of disease-progressing and non-progressing adult
  13.        patients. METHODS: Thirty-two peripheral blood mononuclear cell samples
  14.        were obtained from 29 HIV-infected adults. Cell DNA was isolated and RT
  15.        gene and codon 215-specific oligonucleotides were used in an
  16.        amplification-refractory-to-mutation assay (ARMS) to detect the presence
  17.        of wild type threonine (Thr) or the common mutation,
  18.        tyrosine/phenylalanine (Tyr/Phe). Patients were categorized as
  19.        AZT-resistant (duration of AZT > 18 mo, drop in CD4# > 50%, increase in
  20.        beta-2 microglobulin (B2M) > 1mg/dl, weight loss > 10% body mass) or
  21.        AZT-sensitive (duration of AZT < 4 mo, stable CD4#, B2M, weight).
  22.        Differences between the prevalence of codon 215 mutations were compared.
  23.        RESULTS: Fifteen AZT-sensitive samples were analyzed utilizing the
  24.        primers for human beta-globin, HIV V3, codon 215-Thr, and codon
  25.        215-Tyr/Phe. Eight of 15 (53.3%) samples had > 50% of the PCR products
  26.        derived from 215-Thr, 2 samples had > 50% of the product derived from
  27.        215-Tyr/Phe, 5 samples failed to generate a V3- or codon 215-product.
  28.        Fourteen of 17 (82.4%) AZT-resistant samples had > 50% of the PCR
  29.        products derived from 215-Tyr/Phe. Two samples failed to amplify HIV V3
  30.        and one which did amplify HIV V3 gave equivicol codon 215 results.
  31.        DISCUSSION AND CONCLUSIONS: ARMS PCR is a useful test to rapidly detect
  32.        codon 215 mutations (Thr - or > Tyr/Phe) associated with AZT resistance.
  33.        Eighty-two percent of patients with evidence for clinical resistance and
  34.        20% without evidence of clinical resistance had detectable 215-Tyr/Phe
  35.        mutations. Twenty-five percent of the samples failed to amplify with
  36.        either primer (215-Thr or 215-Tyr/Phe).
  37.  DE    Adult  Codon/GENETICS  Drug Resistance, Microbial/GENETICS  DNA
  38.        Primers/GENETICS  DNA, Viral/BLOOD/GENETICS  Human  HIV Envelope Protein
  39.        gp120/GENETICS  HIV Infections/DRUG THERAPY/*MICROBIOLOGY  HIV-1/DRUG
  40.        EFFECTS/*ENZYMOLOGY/*GENETICS  Peptide Fragments/GENETICS  *Point
  41.        Mutation  Polymerase Chain Reaction/METHODS  Prognosis  Reverse
  42.        Transcriptase/*GENETICS  Time Factors  Zidovudine/THERAPEUTIC USE
  43.        MEETING ABSTRACT
  44.  
  45.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  46.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  47.  
  48.